Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMIM19Q96E16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM19Q96E16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms