Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTP4Q96DX8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms