Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPCDCQ96CD2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPCDCQ96CD2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms