Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ULK4Q96C45 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ULK4Q96C45 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms