Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTI1AQ96AJ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms