Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35C1Q96A29 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35C1Q96A29 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms