Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
SNX21Q969T3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX21Q969T3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms