Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFKQ969G6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms