Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSR2Q969E8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSR2Q969E8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSR2Q969E8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TSR2Q969E8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TSR2Q969E8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TSR2Q969E8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSR2Q969E8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms