Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF7Q92985 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF7Q92985 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF7Q92985 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF7Q92985 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF7Q92985 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF7Q92985 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF7Q92985 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF7Q92985 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms