Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT35Q92764 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT35Q92764 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms