Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOMQ8WWX9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SELENOMQ8WWX9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms