Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBLCP1Q8WVY7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBLCP1Q8WVY7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms