Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
TRIM41Q8WV44 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TRIM41Q8WV44 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms