Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG1Q8WTW3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG1Q8WTW3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms