Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms