Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX54Q8TDD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms