Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PROKR1Q8TCW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms