Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYRIPQ8NFW9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYRIPQ8NFW9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms