Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHDC9Q8NEP7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC9Q8NEP7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms