Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms