Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HJURPQ8NCD3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms