Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUMF1Q8NBK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms