Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms