Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC71Q8N4P6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC71Q8N4P6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC71Q8N4P6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC71Q8N4P6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms