Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLASRPQ8N2M8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLASRPQ8N2M8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLASRPQ8N2M8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms