Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CA13Q8N1Q1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA13Q8N1Q1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms