Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT12Q8IV01 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT12Q8IV01 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT12Q8IV01 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT12Q8IV01 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT12Q8IV01 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT12Q8IV01 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT12Q8IV01 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT12Q8IV01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms