Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228AQ86W67 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228AQ86W67 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228AQ86W67 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms