Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NPM2Q86SE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM2Q86SE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms