Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms