Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP1Q7Z6B7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms