Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAPQ7Z569 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms