Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
STRCQ7RTU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCQ7RTU9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCQ7RTU9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms