Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms