Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms