Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMUB2Q71RG4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms