Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYS1Q717R9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms