Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC55Q6ZSA7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms