Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY4Q6ZNE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY4Q6ZNE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms