Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOXD4L3Q6VB84 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms