Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCBE1Q6UXH8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms