Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSTM1Q6UX27 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSTM1Q6UX27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms