Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms