Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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