Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ULK3Q6PHR2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms