Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms