Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNCKQ6P2M8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms