Protein–RNA interactions for Protein: Q6P0N0

MIS18BP1, Mis18-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18BP1Q6P0N0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18BP1Q6P0N0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18BP1Q6P0N0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIS18BP1Q6P0N0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIS18BP1Q6P0N0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 394.3 ms