Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms